MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Erwinia sp. Ejp617 plasmid pJE04

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017447	GCT	2	6	5	10	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_017447	CAG	2	6	21	26	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_017447	GCC	2	6	62	67	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4	NC_017447	GCC	2	6	76	81	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785425
5	NC_017447	GCT	3	9	83	91	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785425
6	NC_017447	ACGCCA	2	12	94	105	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385785425
7	NC_017447	GCCG	2	8	111	118	0 %	0 %	50 %	50 %	385785425
8	NC_017447	CTGC	2	8	128	135	0 %	25 %	25 %	50 %	385785425
9	NC_017447	AGC	2	6	148	153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785425
10	NC_017447	TGC	2	6	155	160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785425
11	NC_017447	CGG	2	6	194	199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785425
12	NC_017447	CTG	2	6	252	257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785425
13	NC_017447	TGG	2	6	283	288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785425
14	NC_017447	CGC	2	6	307	312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785425
15	NC_017447	TGA	2	6	316	321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785425
16	NC_017447	CTG	2	6	327	332	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_017447	GCT	2	6	351	356	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_017447	CGA	2	6	407	412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785426
19	NC_017447	GCCC	2	8	414	421	0 %	0 %	25 %	75 %	385785426
20	NC_017447	GCT	3	9	425	433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785426
21	NC_017447	CGA	3	9	503	511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785426
22	NC_017447	CGG	2	6	520	525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785426
23	NC_017447	CTTCAG	2	12	659	670	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_017447	TAC	2	6	744	749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017447	CGG	3	9	772	780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_017447	CGG	2	6	923	928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_017447	GGA	2	6	977	982	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385785427
28	NC_017447	ACC	2	6	1020	1025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785427
29	NC_017447	CTG	2	6	1044	1049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785427
30	NC_017447	CTG	2	6	1116	1121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785428
31	NC_017447	GCA	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785428
32	NC_017447	CGG	2	6	1172	1177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785428
33	NC_017447	CGC	2	6	1382	1387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785429
34	NC_017447	CGTG	2	8	1409	1416	0 %	25 %	50 %	25 %	385785429
35	NC_017447	GCG	2	6	1419	1424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785429
36	NC_017447	ACC	2	6	1516	1521	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
37	NC_017447	CGG	2	6	1552	1557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785430
38	NC_017447	CCG	2	6	1607	1612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785430
39	NC_017447	GAC	2	6	1629	1634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785430
40	NC_017447	GCA	2	6	1648	1653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785430
41	NC_017447	CAC	2	6	1663	1668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385785430
42	NC_017447	GCA	2	6	1703	1708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785430
43	NC_017447	GCT	2	6	1709	1714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785430
44	NC_017447	CTT	2	6	1745	1750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385785430
45	NC_017447	CGG	2	6	1757	1762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785430
46	NC_017447	GCT	2	6	1769	1774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785430
47	NC_017447	GCC	2	6	1801	1806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785430
48	NC_017447	AGC	2	6	1807	1812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785430
49	NC_017447	GCC	2	6	1863	1868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785430
50	NC_017447	GCA	2	6	1883	1888	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_017447	GCC	2	6	1901	1906	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_017447	GCT	3	9	1907	1915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_017447	TGC	2	6	1948	1953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017447	ATCG	2	8	1980	1987	25 %	25 %	25 %	25 %	385785431
55	NC_017447	GC	3	6	1995	2000	0 %	0 %	50 %	50 %	385785431
56	NC_017447	CGG	2	6	2006	2011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785431
57	NC_017447	GCC	2	6	2016	2021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785431
58	NC_017447	CGC	2	6	2044	2049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785431
59	NC_017447	TGA	2	6	2077	2082	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385785431
60	NC_017447	CTG	2	6	2103	2108	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785431
61	NC_017447	CTG	2	6	2142	2147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785431
62	NC_017447	GCG	3	9	2154	2162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385785431
63	NC_017447	GGT	2	6	2171	2176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785431
64	NC_017447	GC	3	6	2178	2183	0 %	0 %	50 %	50 %	385785431
65	NC_017447	ACG	2	6	2185	2190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785431
66	NC_017447	TGC	2	6	2191	2196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785431
67	NC_017447	GGT	2	6	2237	2242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785431
68	NC_017447	GAC	2	6	2283	2288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385785431
69	NC_017447	GCT	2	6	2309	2314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785431
70	NC_017447	GCT	2	6	2363	2368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_017447	CGC	2	6	2378	2383	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_017447	GC	3	6	2382	2387	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_017447	CAG	2	6	2460	2465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017447	CGC	2	6	2474	2479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_017447	CGG	2	6	2512	2517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017447	TGG	2	6	2533	2538	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_017447	CAGC	2	8	2558	2565	25 %	0 %	25 %	50 %	385785432
78	NC_017447	AGG	2	6	2572	2577	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385785432
79	NC_017447	GC	3	6	2718	2723	0 %	0 %	50 %	50 %	385785433
80	NC_017447	GGT	2	6	2801	2806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385785433
81	NC_017447	TGC	2	6	2818	2823	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385785433
82	NC_017447	GCC	2	6	2827	2832	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385785433
83	NC_017447	GGCCG	2	10	2837	2846	0 %	0 %	60 %	40 %	385785433
84	NC_017447	TGTT	2	8	2869	2876	0 %	75 %	25 %	0 %	385785433
85	NC_017447	CGCTGC	2	12	2881	2892	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	385785433
86	NC_017447	ACGC	2	8	2937	2944	25 %	0 %	25 %	50 %	385785433
87	NC_017447	GCC	2	6	2953	2958	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_017447	CGCTGG	2	12	2980	2991	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_017447	CGC	2	6	3011	3016	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
90	NC_017447	CTG	2	6	3039	3044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_017447	GGC	2	6	3188	3193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_017447	GCC	2	6	3197	3202	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_017447	GCA	2	6	3224	3229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.